La PFIE est une structure d'expérimentation dont l'activité est essentiellement orientée vers les infections expérimentales, sur gros animaux (ruminants, porcs, équins...), sur volailles (poule, canard...), sur animaux de laboratoire (souris, rat, lapin...) voire sur d'autres espèces (sanglier...) hébergés en bâtiments ou systèmes confinés (isolateurs), de niveaux 1 à 3.

Avec la construction d’un nouveau bâtiment, INPREST (Installations Nationales Protégées pour la Recherche sur les Encéphalopathies Spongiformes Transmissibles) en 2008, la plate-forme constitue le plus grand dispositif expérimental français en infectiologie animale.

Pour garantir la qualité de ses prestations auprès de ses clients et pour avoir une reconnaissance internationale, la PFIE est certifiée selon la norme ISO 9001:2000 depuis le 29 mai 2008 par l’organisme LRQA. Le passage à la norme ISO 9001:2008 a été réalisé en 2010.

Le libellé du certificat est le suivant :

• Réalisation de protocoles expérimentaux en infectiologie animale jusqu'au niveau de confinement A3 sur animaux de laboratoire et animaux de rente : de la souris aux bovins ;
• Production et fourniture d'animaux à statut sanitaire ou génétique contrôlé (conventionnel, EOPS, axénique, transgénique) pour la recherche.

La PFIE est la plus importante structure de l’Inra a être certifiée, elle compte plus de 50 agents et plus d’une vingtaine d’activités différentes.

La PFIE est également reconnue plate-forme par le GIS IBiSA, Groupement d'Intérêt Scientifique Infrastructures en Biologie, Santé et Agronomie.