Les recherches sur la vigne au Département de Génétique et d'Amélioration des Plantes portent sur l'analyse de la diversité génétique de l'espèce, sur le déterminisme génétique et moléculaire de caractères d'intérêt agronomique (qualité de la baie, résistance aux bio-agresseurs, tolérance à différentes contraintes du milieu). Les résultats sont utilisés pour la sélection de variétés innovantes de raisins de cuve et de table .

Dans le domaine de la gestion des ressources génétiques, le groupe gère une collection de renommée internationale, comportant plus de 2500 variétés, ainsi que plusieurs collections de clones cultivés dans les grandes régions de production (de 100 à 450 clones, selon les cépages). Ces ressources sont bien caractérisées d'un point de vue ampélographique et commencent à être décrites d'un point de vue moléculaire. Une grande partie de ces ressources constitue la collection nationale de ressources génétiques de la vigne (coordonnée par le Bureau des Ressources Génétiques - BRG) et est accessible à la collectivité internationale.

Des études sont entreprises pour inventorier et mieux connaître les ressources génétiques sauvages présentes dans la nature, apprécier leur diversité génétique et la comparer à celle des espèces cultivées. Les travaux visent aussi à préciser les possibilités et modalités de flux géniques entre les compartiments sauvages et cultivés. L'étude des bases génétiques de la variation concerne prioritairement les caractères intervenant dans :

• le développement de la plante (vigueur conférée par le porte-greffe ; reproduction ; fructification) ;
• la qualité de la baie de raisin (tanins, composition physico-chimique, précurseurs d'arômes pour les raisins de cuve ; absence de pépins, teneur en sucres, arôme muscaté pour les raisins de table) ;
• la résistance à différents bioagresseurs des variétés (oïdium, mildiou, maladies du bois et maladies à phytoplasme) et des porte-greffes (virus) ;
• l'adaptation à différentes contraintes ou composantes du milieu, notamment au terroir.

Des travaux de cartographie génétique sont développés pour préciser les déterminants génétiques de ces différents caractères et développer les outils cellulaires et moléculaires permettant d'améliorer l'efficacité des schémas de sélection. Un programme de génomique a été mis en place récemment dans le but de construire des ressources spécifiques à l'étude du génome de la vigne, notamment en vue d'identifier quelques gènes impliqués dans la réalisation des caractères précédents.

L'ensemble de ces travaux devrait permettre de créer des variétés innovantes d'ici quelques années, les innovations majeures devant porter sur des variétés plus respectueuses de l'environnement et en maintenant un bon niveau de qualité.