Génétique animale - Structure du génome

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Structure et fonctionnement des génomes animaux

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Cette thématique prend en compte la disponibilité de la séquence d’un nombre croissant de génomes, y compris des animaux d’élevage. Elle met l’accent sur la cartographie comparée entre espèces, sur les polymorphismes (en particulier SNP) et leur structuration, sur la bioinformatique, sur l’analyse de l’expression des gènes et sur l’organisation fonctionnelle du noyau.

1. Cartographie des génomes

Dans certaines espèces d’élevage, le séquençage du génome est réalisé (poule, bovin, cheval) ou prévu à court terme (porc, lapin, mouton). L’enjeu immédiat est d'une part de s’intégrer aux consortiums internationaux, ce qui permet de valoriser le travail déjà réalisé mais aussi de construire les...

2. Polymorphismes moléculaires

Les séquences de base étant connues, l’analyse de la variabilité de ces séquences devient une thématique essentielle, en particulier la variabilité de type SNP.

3. Génomique fonctionnelle

Les études de l’expression des gènes et de leurs régulations sont développées au niveau de la cellule, du tissu ou de l’organe pour appréhender les mécanismes d’expression dans leur ensemble et accéder aux régulations de réseaux géniques, clés du contrôle génétique des fonctions étudiées.

4. Bioinformatique

Dans tous les aspects de la biologie intégrative, la bioinformatique joue un rôle central. Parmi ses différentes composantes, nous investissons plus particulièrement dans la cartographie comparée in silico, les polymorphisemes SNP, l'analyse des données d'expression et l'intégration des données.

5. Cartographie fonctionnelle et phénomènes épigénétiques

La structure du génome ne permet pas d'appréhender l'activité coordonnée d'ensemble de gènes au sein d'une cellule. C'est l'objectif affiché de cette thématique de cartographie fonctionnelle.

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Rédaction : PHuan
Date de création : 13 Septembre 2007
Mise à jour : 04 Mai 2009

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