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Les généticiens au coeur de la sélection animale


© photothèque INRA
En confiant depuis 1966 au département de Génétique Animale de l’INRA la responsabilité de la base de données zootechniques nationale et de l’évaluation des reproducteurs, la loi sur l’Elevage a placé durablement l’INRA au cœur du dispositif de sélection français.
La Loi d’Orientation Agricole de 2006 a confirmé ces missions, reconnaissant l’intérêt et l’efficacité de ce dispositif fondé sur la complémentarité de compétences. Le Centre de Traitement de l’Information Génétique (CTIG) de Jouy est ainsi à la fois le centre de calcul du département mais le gestionnaire des bases nationales, à des fins d’évaluation génétique et de recherche.
 
Le département concentre ainsi l’essentiel des compétences françaises en génétique quantitative animale et il a construit un partenariat intense avec le milieu de la génétique animale. Dans ce contexte, le département travaille en étroite collaboration avec l’Institut de l’Elevage (IE) et l’Institut Technique du Porc, les deux structures en charge du développement technique en France. Ainsi, 9 personnes de l’IE sont hébergées par le département à des fins de valorisation de l’évaluation génétique, et deux Unités Mixtes Technologiques ont été labellisées en 2006 à Jouy et 2007 à Toulouse.
 
Les relations de confiance et de longue date ont également favorisé la construction de collaborations qui dépassent largement le strict domaine de l’évaluation génétique. Nous sommes très impliqués comme force de proposition dans l’élaboration des objectifs de sélection, en veillant tout particulièrement à la durabilité de la gestion des populations. Dans le cadre de la Commission Nationale d’Amélioration Génétique et, depuis 2006 dans le cadre de l’Interprofession génétique France Génétique Elevage, nous participons à la cogestion de la sélection française, particulièrement dans le cas des ruminants. Dans plusieurs espèces, des lignées INRA ont été ou sont encore des noyaux de sélection largement diffusés. Nous formons des thésards cofinancés par les professionnels et qui deviennent ensuite leurs cadres.
 
Même dans les domaines avicole et aquacole exclus de la loi sur l’Elevage, alors que l’INRA n’est qu’un des interlocuteurs possibles à l’échelle internationale, on observe un partenariat croissant entre l’INRA et les sélectionneurs français, en particulier par l’intermédiaire du SYSAAF, lié à l’INRA par plusieurs conventions de collaboration. Alors que la maturité croissante des filières distendre les relations avec l’INRA, l’enjeu de la génétique moléculaire et l’émergence de ses applications renforcent au contraire nos relations. Depuis 1994, le GIE Labogena associe l’INRA et divers partenaires professionnels pour offrir un outil de génotypage à des fins de contrôle de filiation et de sélection. Dans une situation concurrentielle, Labogena garde une part de marché importante sur son secteur d’activité et constitue un outil de transfert privilégié entre l’INRA et les filières. Chez les bovins laitiers, un programme à grande échelle de sélection assistée par marqueurs est en place depuis 2001.
 
De longue date également, nous sommes partenaires de diverses instances impliquées dans la sauvegarde des ressources génétiques, en particulier du Bureau des Ressources Génétiques et de la Cryobanque Nationale.
 
En 2001, ces relations de confiance ont sans doute beaucoup contribué à l’adhésion des professionnels au programme Agenae. Agenae est un groupement d’intérêt scientifique rassemblant l’INRA et le CIRAD d’une part, les filières professionnelles bovine, piscicole, porcine et avicole. Cette structure a une triple vocation : orienter la recherche en génomique animale en associant les filières au processus de décision et au financement ; organiser une offre de recherche cofinancée, éligible à des crédits incitatifs du Ministère de la Recherche ; mettre en place les structures nécessaires à la réalisation de ces projets : CRB, plates formes transcriptome, bioinformatique. Agenae dépasse bien entendu largement le contour du département de génétique animale mais nous avons joué un rôle moteur dans sa définition, la mise en place des outils et un scientifique du département en assure actuellement la direction. Cette structure permet de mobiliser plusieurs millions d’euros par an, du Ministère de la Recherche et des filières professionnelles.
Rédaction : PH
Date de création : 25 Octobre 2007
Mise à jour : 20 Janvier 2009