Contribution de l'INRA
à la connaissance du génome d'Arabidopsis
L'exploration du génome d'Arabidopsis thaliana (l'arabette des
dames), a débuté depuis plus de dix ans. Ces travaux débouchent
sur la publication par la revue Nature dans son édition du 14
Décembre 2000 de la séquence du génome de cette petite plante
de la famille du chou et du colza (les Brassicacées), devenue
l'espèce modèle pour la plupart des études en biologie et en génétique
végétale. En raison de la quantité et de l’exhaustivité de l’information
collectée, c’est un événement scientifique remarquable, qui aura
un impact majeur pour la biologie des plantes et qui ouvre de
nombreuses perspectives pour l’agriculture.
La contribution de l'INRA à cet effort collectif a été important.
En amont du séquencage du génome proprement dit, la réalisation
d'une carte physique et d’un inventaire des gènes exprimés ont
contribué à la faisabilité du séquençage et à l’interprétation
de la séquence du génome de cette plante. Le développement de
logiciels de bio-informatique permettant de déchiffrer la séquence
obtenue et d’établir systématiquement où se trouvent les gènes
est un autre aspect auquel plusieurs équipes de l’INRA ont participé
et sur lequel elles continuent d’être actives.
Parallèlement, les équipes de l'INRA se sont engagées très tôt
dans l'étude de la fonction des gènes d'Arabidopsis. Les chercheurs
ont tout d’abord mis au point une méthode originale d'inactivation
des gènes de la plante pour en comprendre la fonction. Une collection
de 50.000 plantes mutantes a ainsi été constituée. L'exploration
de cette collection se poursuit aujourd'hui par le repérage, à
l'échelle moléculaire, des gènes inactivés, notamment dans le
cadre du programme Génoplante. D’autre part, les travaux de bio-informatique
sont poursuivis pour “ annoter ” la séquence aujourd’hui complète
du génome de l’arabette, pour améliorer la recherche des gènes,
et pour collecter et analyser les informations obtenues par les
méthodes expérimentales afin d’attribuer une fonction à chacun
des gènes localisé sur la séquence. De cette façon, les données
issues du séquençage et celles concernant l’étude de la fonction
des gènes se rejoignent. L’ensemble constitue un outil puissant
pour le progrès des connaissances en biologie et génétique végétale.
La connaissance du génome d’Arabidopsis n’est pas seulement un
enjeu de recherche fondamentale. Les génomes des plantes supérieures
sont en effet fortement apparentés. Les connaissances acquises
sur Arabidopsis sont donc dans une large mesure extrapolables
aux plantes cultivées, ce qui ouvre de nouvelles voies pour l’amélioration
génétique des plantes.
Contact scientifiques:
David Bouchez, Laboratoire de Biologie Cellulaire, Centre INRA
de Versailles
Georges Pelletier, Laboratoire de Génétique et amélioration des
plantes, Centre INRA de Versailles
Pierre Rouzé, Laboratoire Associé de l'INRA, Department of Plant
Genetics, Université de Gand (Belgique)
Presse Info - Décembre
2000
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147, rue de l'Université - 75338 Paris cedex 07
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