Les bases de données scientifiques de l'INRA

Bioclimatologie

• Oilseed Rape Châlons Database - Unité de Recherche en Bioclimatologie de Grignon

• Base de données agroclimatiques de l'INRA - Service technique d'étude des facteurs climatiques et de l'environnement

Biologie des organismes

• BAZAR : Base de données aranéologique - Partie bibliographique

• Catalogue des lépidoptères des Antilles Françaises - Unité de Phytopharmacie et Médiateurs Chimiques de Versailles

  Ce catalogue permet de déterminer les espèces de Lépidoptères présentes dans les Antilles Françaises et de faire le point sur les connaissances actuelles relatives à leur biologie et leur répartition.

• HYP3 : Base de données encyclopédique en pathologie végétale, extraite du cédérom HYPP (Réalisation INRA/ACTA) - unité de pathologie végétale de Versailles

• HYPPZ : Base de données encyclopédique sur les ravageurs (insectes, acariens, rongeurs, nématodes, gastéropodes et petits vertébrés) importants en europe Occidentale (Réalisation INRA/ACTA). Contient:
  • 300 fiches illustrées de photographies en couleur
  • un glossaire de zoologie
  • un tableau des cultures et des arbres fruitiers concernés

• HYPPA : Base de données encyclopédique sur les adventices de l'Europe occidentale. Version complétée et limitée aux adventices du CD-ROM HYPP© (réalisation INRA/ACTA) - Unité malherbologie et agronomie, Dijon

Biologie moléculaire et génome

• Serveur génome

• AGROBACT : base de données de la collection de transformants d'Arabidopsis thaliana de l'INRA de Versailles

  Base accessible uniquement par les participants du G.D.R "Génomes" : Réalisation et exploitation d'une collection de mutants d'insertion d'ADN-T chez Arabidopsis Thaliana.

• Arabidopsis Genes Retrieval Database : base de données bibliographique sur Arabidopsis thaliana spécialisée en génomique

• Cartographie du chromosome 3 D'Arabidopsis - Unité de biologie cellulaire de Versailles

• Analyse différentielle de l'expression des transcrits d'Arabidopsis sur filtres à haute densité - Unité de biologie cellulaire de Versailles

• dbEST et cDNA sequences : bases de données génomiques d'ectomycorhizes (infoservice Mycorweb)- Unité microbiologie, biogéochimie et pathologie des écosystèmes forestiers de l'INRA de Nancy

  2 bases accessibles :

  • dbEST : base d'étiquettes de séquences exprimées d'Ectomycorhizes de Eucalyptus globulus-Pisolithus tinctorius
    
  • Séquences d'ADNc d'ectomycorhizes de E.globulus-P.tinctorius

• Génétique biochimique, cytologique et microbienne - Bâtiment des biotechnologies de l'INRA de Jouy-en-Josas

  Accès à la base de données sur Bacillus Subtilis du laboratoire de microbiologie, à la carte génétique des bovins et à la liste des serveurs WWW de biologie moléculaire

• GrainGenes: Base Miroir de la base de données internationale GrainGenes qui se trouve à l'Université de Cornell aux USA.

  GrainGenes est une base de données génétique concernant la famille des Gramineae en général et en particulier concernant les Triticeae, l'avoine et la canne a sucre. La base GrainGenes officielle localisée à l'Université de Cornell dispose d'un grand nombre d'informations :

  • cartes génétiques et cytogénétiques,
  • clones génomiques, séquences nucléotidiques, gènes, allèles et produits de gènes,
  • caractères phénotypiques et QTL (Quantitative Trait Loci),
  • génotypage et pedigree de nombreux cultivars, stocks génétiques (lignées aneuploides) et autres germplasmes, maladies et pathogènes associés, résistance aux insectes, stress abiotique,
  • taxonomie des Triticeae et Avenae, et germplasme
  • adresses et domaines de recherche de nombreux chercheurs à travers le monde,

• French Triticeae Mapping Initiative (FTMI) - Initiative française de la cartographie des triticinées

• ESTHER - Accès à la base de données sur les alpha/beta hydrolases (cholinestérases) de l'unité de différenciation cellulaire de Montpellier

• Base EGID - Agrumes : Evaluation et gestion Informatique de la Diversité Génétique
  EGID est un logiciel sous Windows 3.1 qui permet de gérer une collection d'agrumes. Il permet d'associer des données textuelles, numériques et photographiques. Exemple de la liste des variétés disponibles à la Station de recherches Agronomiques de Corse

• Predotar - Un service pour la prédiction des séquences d'adressage mitochondrial ou chloroplastique - Station de génétique et d'amélioration des plantes - INRA Versailles

• ProDom - Accès à la base ProDom de familles de domaines protéiques (Sonnhammer E.L.L. & Kahn, D., 1994, Protein Sci. 3:482-492) - Laboratoire de Biologie Moléculaire des Relations Plantes-Microorganisme de Toulouse

  Ce serveur permet de visualiser de manière interactive l'arrangement en domaines de familles de protéines homologues.

  The ProDom protein domain database consists of an automatic compilation of homologous domains detected in the SWISS-PROT database (Bairoch A, Boeckmann B, 1991, Nucleic Acids Res., 19:2247-2249) by the DOMAINER algorithm (Sonnhammer, E.L.L. & Kahn, D., 1994, Protein Sci. 3:482-492). It has been devised to assist with the analysis of the domain arrangement of proteins.

Environnement

• Sols et Paysages en Languedoc-Roussillon - Unité Science du sol de Montpellier

Ressources génétiques

• Bases légumineuses à grosses graines

  Ressources génétiques et bases de données des différentes espèces de légumineuses à grosses graines, travaillées à l'INRA.

• Le Lin

  Présentation de la collection Lin de l'INRA

Toxicologie et écotoxicologie des pesticides

• AGRITOX - base de données sur les propriétés physiques et chimiques, la toxicité, l'écotoxicité, le devenir dans l'environnement, les données réglementaires des substances actives phytopharmaceutiques autorisées en France.

Institut National de la Recherche Agronomique

Mise à jour: 27 décembre 2001
URL: http://www.inra.fr/indexbdd.html