programme agroBI

"Depuis une dizaine d’années, l’essor de la génomique et des approches moléculaires qui lui sont associées a été porté par des programmes nationaux de grande ampleur : projets du CNS, programmes GENOPLANTE, GENANIMAL et AGMIAL, nombreuses ACI du ministère chargé de la recherche, programme bioinformatique inter-organismes, …
Ces programmes ont été accompagnés par la mise en place de plates-formes (de génotypage, de transcriptomique, de protéomique, de bioinformatique et, plus récemment, de métabolomique, …) et la constitution de Centres de Ressources Biologiques au niveau national. Au sein de l’INRA, cet essor a été soutenu, entre autres depuis 2001, par une AIP, dite "AIP Séquençage", et, de 2000 à 2004, par une AIP Bioinformatique en soutien au programme inter-EPST.
Après une décennie consacrée à l'essor des démarches en génomique (biologie moléculaire, séquençage, mécanismes cellulaires, …), où la question de recherche s'est focalisée avant tout sur la séquence et le gène (détection, caractérisation, annotation, recherche de fonction, interactions), beaucoup de projets visent aujourd'hui à une compréhension plus globale du fonctionnement des organismes dans leur contexte biotique et abiotique (développement des organismes, fonctionnement et évolution des populations dans leur environnement). voir quelques exemples de projets à l'INRA, voir aussi quelques diapos de synthèse sur des thématiques INRA.

La communauté scientifique dispose aujourd'hui d'un volume considérable de données de nature et d'origine différentes, de dispositifs technologiques avancés, d'informations complexes sur les espèces dites modèles, ce qui permet de déplacer la question de recherche vers l'étude approfondie des fonctions biologiques complexes et des mécanismes génétiques et génomiques sous-jacents.

La Biologie intégrative s’impose comme un nouveau paradigme dont l’objectif est de « donner du sens » aux approches analytiques de la génomique ou d’intégrer les informations acquises à différents niveaux d’approche pour donner une explication et une signification aux processus étudiés.

En 2006, l'INRA a lancé un programme agroBI de Biologie intégrative pour 2006-2008, et l'ANR a lancé un programme BIOSYS.
Dans le but de favoriser le développement de ces approches intégratives, le rôle du programme agroBI sera de contribuer à l’émergence, et de soutenir, des projets de recherche associant des disciplines distinctes (génétique, génomique, (éco)physiologie, physiopathologie, biologie cellulaire et structurale, biochimie, évolution, phylogénie, imagerie, mathématiques et informatique appliquées, …), et comportant notamment une composante explicite de modélisation et/ou de bioinformatique. ... " ...>> (voir le texte complet de l'appel à proposition)

le rapport final du programme agroBI, qui présente la liste des 11 projets sélectionnés, est disponible ici