Cent-mille milliards de bactéries !Chacun de nous héberge cent mille milliards de bactéries constituant la flore digestive. Stérile avant la naissance, notre tube digestif est rapidement colonisé par cette flore complexe et diversifiée qui se stabilise au cours des premières années de la vie. Le tube digestif est (ainsi) un organe à part entière et les interactions entre l’organisme et la flore digestive participent au maintien en bonne santé. Alors que nous associons souvent "bactéries" et "maladie", notre flore digestive en équilibre comprend essentiellement des bactéries dont les fonctions nous sont bénéfiques en termes de nutrition et de santé. Dès la naissance, l’alimentation influence l’équilibre entre l’organisme et la flore qu’il héberge. Cela peut également avoir une importance en matière de santé. Microbiologie digestive, nutrition humaine et sécurité alimentaireLe consommateur qui vit aujourd’hui dans un monde en constante évolution est légitimement demandeur d’éclaircissements et de recommandations en matière de nutrition. Les industries agro-alimentaires se doivent d’accompagner les évolutions de la société moderne en adaptant leur offre à la diversité des groupes humains, tout en apportant les garanties maximales en matière de sécurité alimentaire. Le monde médical et pharmaceutique est dans le même temps engagé dans une course contre la montre face au développement de multi-résistances aux antibiotiques chez les bactéries pathogènes et pourrait mettre à profit des stratégies alternatives. Les travaux de recherche du secteur Nutrition humaine et sécurité alimentaire de l’Inra dans le domaine de la microbiologie digestive s’inscrivent dans ces enjeux majeurs de notre société. Biodiversité microbienne intestinale et nutrition humaineAfin de prendre part à la définition d’une nutrition préventive des grandes pathologies de l’homme il nous faut acquérir une meilleure connaissance des interrelations aliment-microflore-hôte et de leur impact sur l’écologie microbienne et le fonctionnement du système digestif. La connaissance de la biodiversité de la microflore et de ses fonctions constitue un domaine d’étude primordial que les outils moléculaires modernes ont fait énormément progresser. Nous savons aujourd’hui que chaque adulte héberge une diversité microbienne dominante faite d’une centaine d’espèces qui sont intimement associées à l’hôte qui les porte et qui restent remarquablement stables au fil des années. Par ailleurs, très peu d’espèces microbiennes apparaissent communes à plusieurs individus, la biodiversité microbienne intestinale est ainsi incommensurable. Bien qu’elle soit plus complexe à mettre en œuvre, une analyse de la diversité fonctionnelle globale de la microflore intestinale se développe aujourd’hui. De ces connaissances émergera une meilleure maîtrise des fonctions physiologiques intestinales favorables au maintien de la santé et à la prévention de pathologies digestives.
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