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L’Inra a intensifié, depuis 2006, les recherches sur les grippes animales (aviaire, porcine, équine) dans l’organisation génomique des virus et la structure des protéines virales, l’analyse des déterminants moléculaires et structuraux de la "pathogénicité", la réponse de l’hôte, y compris l’analyse de la variabilité de cette réponse, la stratégie vaccinale chez le porc et la volaille, l’épidémiologie. Cette implication de l’Inra dans les grippes s’est mise en place par un redéploiement de moyens. Dix équipes de recherche sont totalement ou partiellement engagées dans des programmes Influenza aviaire. L’émergence du pôle "Santé Animale" de Tours, adossé à la plate-forme d’infectiologie expérimentale intégrant les Installations nationales protégées pour la recherche sur les encéphalopathies spongiformes transmissibles (Inprest) est aussi un élément de structuration pouvant soutenir cette orientation sur les influenza.
L’Inra a développé différentes collaborations inter-organismes (Afssa, Écoles nationales vétérinaires, Cirad, CNRS, Institut Pasteur, Direction générale de l’alimentation du ministère de l’Agriculture et de la pêche - DGAL).
"Bureau des grippes"
Depuis 2005, un "bureau des grippes" a été constitué par le département Santé animale de l’Inra pour coordonner ses recherches sur l’influenza aviaire (peste aviaire chez les oiseaux, grippe aviaire chez l’homme) avec ses partenaires. Il rassemble l’Inra, le CNRS, le Cirad, l’Afssa et l’Institut Pasteur. L’activité soutenue par les équipes de l’Inra concerne la diversité et la biologie virale, la réponse cellulaire et immuno-pathologique des hôtes (modèle murin, gallinacées, palmipèdes), l’innovation et les stratégies vaccinales, l’épidémiologie et les interactions avec la faune sauvage.
Le fonds de soutien à la recherche sur l’influenza aviaire (FRIA)
La coordination entre la DGAL, l’Inra et l’Afssa est formalisée depuis février 2008 par la convention FRIA incluant la création d’un fonds spécial de 2 millions d’euros. L’Inra assure la gestion du fonds et le secrétariat des comités de pilotage et du conseil scientifique. La convention concerne en 2008 trois axes de recherche : la problématique des souches faiblement pathogènes, les virus et les milieux, les moyens de prévention et de contrôle. L’Inra participe à quatre projets de recherche sur les sept projets d’ores et déjà mis en œuvre :
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Étude comparée de la réponse immunitaire chez le canard et le poulet vis-à-vis des virus influenza aviaires faiblement pathogènes et évaluation des conséquences sur leurs capacités de réinfection ;
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Facteurs de risque et potentiel pathogène des virus influenza aviaires chez le poulet et le canard ;
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Mise au point et évaluation d’un vaccin sous-unitaire constitué de pseudo particules de virus influenza aviaire (produites en système adénovirus). Intérêt chez les volailles et en particulier pour le canard ;
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Recherche pour l’évaluation en Asie du Sud Est de la surveillance de l’Influenza Aviaire.
La coordination entre l’Inra et l’Institut Pasteur passe par des programmes transversaux de recherche communs (PTR)
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Rôle des protéases dans l’influenza aviaire ;
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Adaptation à la volaille domestique d’un virus grippal issu de l’avifaune sauvage : mécanismes moléculaires mis en jeu lors de la sélection de mutants de délétion dans la tige de la neuranimidase (NA), impact sur la physiologie de l’infection.
Domaine d’intérêt majeur (DIM)
L’Inra participe également au Domaine d’intérêt majeur (DIM) "Maladies infectieuses, parasitaires, nosocomiales émergentes" en Île-de-France (4,5 millions d’euros), coordonné par l’Institut Pasteur, dont l’objectif vise à renforcer la lisibilité de la politique régionale et son caractère fédérateur en soutenant des programmes de recherche sur des thématiques ciblées.
Programme ANR
L’Inra coordonne ou participe à six projets s’inscrivant dans le cadre de programmes de l’Agence nationale de la recherche (ANR), soit 60 % des programmes ANR sur l'Influenza. Dans le cadre du programme Microbiologie, immunologie et maladies émergentes, l’Inra coordonne le projet Flubudentry - virus de la grippe, entrée et bourgeonnement et participe au projet Flupropar - étude de la modulation de l’infection grippale par les protéases et les anti-protéases de l’hôte. Dans le cadre du programme Genanimal, l’Inra coordonne le projet Genaviflu - génétique de la susceptibilité à l’influenza aviaire chez les oiseaux domestiques.
Enfin, dans le cadre du programme Santé-environnement et santé-travail (SEST), l’Inra participe aux projets : Bioscope - Observatoire du vivant en méditerranée, Ecoflu - virus de l’influenza aviaire dans l’environnement : identification des conditions d’émergence et de persistance pour l’amélioration des réseaux de surveillance et Migravflu - épizooties introduites par la faune sauvage : risques associés aux influenza aviaires.
Autres projets nationaux
Un projet est soutenu en commun par l’Inra et le Cirad : Géographie de la santé : étude du rôle des facteurs sociaux et économiques dans la persistance de la grippe aviaire à H5N1 en Thaïlande.
Programmes européens
L’influenza aviaire fait l’objet de projets européens dans le cadre du 6e PCRD et fait l’objet de financements dans le cadre du prochain 7e PCRD.
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Rex (réseau d’excellence) : Eadgene (génomique des interactions hôte agents pathogènes)
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PI (projet intégré) : Eden (maladies émergentes et changements environnementaux)
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Nadir (infrastructures en infectiologie animale)
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Era Net Emida (maladies infectieuses majeures et émergentes du bétail)
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SCAR – WG Animal health and animal Wellfare
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Participations aux Rex : EpiZone, MedVetNet
Projets Inra entièrement soutenus par l'Institut
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Projet "Inra – soutien aux projets en phase de pré-valorisation" : Nanneau-M2. Nano-particules chimériques Influenza-Virus respiratoire syncitial à but vaccinal. Analyse des potentialités vaccinales
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Projet "Dépt. SA Innovation en SA" : Criblage rationnel de drogues anti-Influenza ciblant la protéine NP, son oligomérisation et son interaction avec l’ARN
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