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Des projets en partenariat


Virose de la sharka, symptômes sur abricot
© Inra, J. Rougier
Les recherches sur la sharka sont menées en collaboration avec des partenaires nationaux, européens et internationaux.

 

Partenariats internationaux


  • SharCo (Sharka containment) : un projet européen intégré coordonné par l’Inra

Le leadership de l'Inra sur la connaissance du virus de la sharka et sur le développement de variétés fruitières résistantes l’a conduit à coordonner le projet européen SharCo "Sharka Containment" qui a été sélectionné au premier appel à propositions du 7e programme cadre européen de recherche et développement. Ce projet a pour ambition de mettre au point une stratégie de lutte intégrée prenant en compte toute la chaîne de production et ses acteurs afin de prévenir l’extension de la maladie. Il vise à combiner des solutions prophylactiques (détection, protection des cultures) et des solutions génétiques et biotechnologiques (développement de résistances) pour prévenir ou limiter la prévalence du virus de la sharka. Ce projet (2008-2012) implique 17 instituts issus de 12 pays européens et d’Amérique du Nord.

  • Programmes européens de mobilité bilatéraux ou multilatéraux

Ces programmes (Programme d’actions intégrées, ECO-NET) s’inscrivent également dans le cadre du 7e programme cadre européen de recherche et développement.

  • Épidémiologie : un projet franco-britannique soutenu conjointement par le BBSRC et l’ANR

Le projet EPIEVOL associe des chercheurs de l’Inra, de Montpellier et Avignon (France), de l’Université de Glasgow (Écosse) et de l’Institute for Animal Health (Angleterre) afin de proposer une approche intégrant dans un cadre méthodologique commun les données génétiques et épidémiologiques collectées au cours des épidémies virales, en modélisant les processus évolutifs ayant lieu au sein d’un individu et entre individus. Il s’agit d’un projet essentiellement méthodologique pour lequel, dans un souci de généricité, on travaille simultanément sur un virus touchant des plantes (la sharka) et un virus touchant des animaux (la fièvre aphteuse). Les méthodes développées au cours de ce projet devraient permettre d’améliorer la caractérisation des chaînes de transmission qui sous-tendent le développement des épidémies. Ce projet est financé dans le cadre du programme Sysbio, cofinancé par l'Agence nationale de la recherche (ANR) et le Biotechnology and biological sciences research Council (BBSRC), qui vise à développer les partenariats franco-britanniques dans le domaine de la biologie systémique.

Partenariats nationaux


  • Un programme national en partenariat avec Viniflhor et le ministère de l’Agriculture et de la Pêche

Ce projet aborde deux aspects complémentaires de la lutte contre la sharka.
La lutte génétique, d’une part. Ce volet du projet vise à acquérir des connaissances en amont sur les facteurs de résistance à la sharka, en même temps qu’à caractériser les matériels disponibles et à exploiter de nouvelles sources de résistance. En effet, des travaux entrepris depuis de nombreuses années ont permis d’identifier des sources intéressantes de résistance, notamment chez l’abricotier et chez Prunus davidiana, espèce sauvage apparentée au pêcher. Des hybrides obtenus par croisement avec certains de ces géniteurs sont en cours d'évaluation dans plusieurs laboratoires européens (Inra Avignon, France ; IVIA Valence, Espagne ; Université de Lednice, République Tchèque). Les chercheurs de chaque institut tentent de vérifier la stabilité et l’efficacité de ces résistances, d’en préciser le déterminisme génétique et d'identifier les régions génomiques impliquées (QTL ou Quantitative Trait Locus). Cependant, l'exploitation de ces sources de résistance polygéniques et complexes n’est envisageable qu’avec le développement d’outils moléculaires ciblés afin de faciliter la compréhension des mécanismes mis en jeu, de rationaliser le choix des géniteurs en croisement et d’accélérer et améliorer l’efficacité du processus de sélection variétale. Le but est d’identifier des marqueurs fiables et de mettre en place une sélection assistée par marqueurs efficace pour la résistance à la sharka. En parallèle, de nouvelles sources de résistance sont recherchées à partir de connaissances acquises chez la plante modèle Arabidopsis thaliana.
L’épidémiologie, d’autre part. Pour ce volet, le projet vise à apporter des éléments nouveaux pour améliorer le système actuel de surveillance et de lutte contre la sharka. Le programme s’appuie sur deux axes principaux : (1) améliorer la connaissance de la dynamique épidémique et des facteurs de risque à une échelle régionale et (2) développer et mettre en œuvre des dispositifs expérimentaux permettant une évaluation des risques épidémiques liés à des variants du virus. Ce programme s’appuie sur des collaborations étroites avec les organismes en charge de la lutte contre la maladie.

  • Écologie et adaptation des insectes phytophages et gestion de leurs populations

Ce programme, financé par Ecoger, aborde l’étude des interactions plantes-hôtes / insectes-vecteurs / pathogènes, et en particulier l’importance de l’adaptation à la ressource et des stratégies de dispersion des phytophages sur l’épidémiologie des agents pathogènes qu’ils transportent.

  • Projet dans le cadre du Programme "Pour et sur le développement régional"
Ces travaux s’appuient sur un co-financement de l’Inra et de la région Languedoc-Roussillon.


Contact scientifique : Thierry Candresse – Thierry.Candresse@bordeaux.inra.fr
Unités : Unité de recherche Génétique et amélioration des fruits et légumes, Inra Avignon – Unité mixte de recherche Génomique, diversité et pouvoir pathogène, Inra-Université Bordeaux II – Unité mixte de recherche Biologie et génétique des interactions plantes/agents pathogènes, Inra-Cirad-Montpellier SupAgro
Départements : Génétique et amélioration des plantes, Santé des plantes et environnement


 

Rédaction :  Jean-Marc Audergon, Thierry Candresse, Sylvie Dallot, Véronique Decroocq, Gérard Labonne et Mission communication
Date de création : 14 Octobre 2008
Date de dernière mise à jour : 16 Octobre 2008

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