Projet proposé :
Le tube digestif représente le site privilégié d’échanges mutuels entre cellules eucaryotes et procaryotes. En effet, l’intestin, principalement dans ses segments distaux, abrite une communauté bactérienne, abondante, diversifiée, et qui communique avec l’hôte. Le rôle de ce microbiote intestinal vis-à-vis de la santé a fréquemment été l’objet d’attentions particulières. Les données accumulées ces dernières années indiquent qu’il occupe une place prépondérante dans la physio-pathologie de l’individu et son maintien en bonne santé.
Notre projet s’inscrit dans une meilleure compréhension du dialogue entre bactéries intestinales et épithélium digestif. Compte tenu de ses fonctions, à l’interface entre l’environnement digestif et l’organisme, le maintien de l’intégrité de l’épithélium est essentiel à la santé de l’individu. De plus, le renouvellement cellulaire de l’épithélium intestinal se fait de façon régulière et rapide tout au long de la vie. Notre objectif est, précisément, d'étudier le rôle du microbiote vis-à-vis de la maturation et du renouvellement cellulaire de l'épithélium intestinal.
Objectifs :
- A- Etudier in vivo le rôle de bactéries pionnières dans la colonisation du tube digestif vis-à-vis de la maturation et du renouvellement cellulaire de l’épithélium intestinal. Les bactéries pionnières proviendront soit de fèces prélevés chez des nouveaux-nés, soit d’un panel de bactéries probiotiques. La maturation de l’épithélium au niveau des parties distales (côlon, iléum) et proximale (duodénum) du tractus digestif sera étudiée à travers 1/ la structure de l’épithélium 2/ la composition des différents types cellulaires présents au niveau de l’épithélium 3/ l’étude de protéines impliquées dans le contrôle du renouvellement intestinal.
- B- Etudier les mécanismes cellulaires et moléculaires sous-jacents aux effets du microbiote sur les processus de prolifération et de différenciation des cellules épithéliales intestinales. Ce travail impliquera des modèles de cellules en culture à l’aide desquelles nous étudierons les voies de signalisation majeures impliquées dans la prolifération et la différenciation intestinale. Pour cela, nous avons déjà mis au point des conditions de co-incubation entre bactéries et lignées cellulaires qui permettent de mimer les effets décrits in vivo.
- C- Identifier les facteurs bactériens impliqués dans la réponse de l’hôte.
Compétences de l'équipe :
Ce projet sera réalisé dans l’équipe "Interactions des bactéries commensales et probiotiques avec l’hôte" dirigée par P. Langella (Unité Micalis ; INRA; Jouy-en-Josas). Dans le contexte international particulièrement compétitif des interactions bactéries - hôte, nous bénéficions : 1/ d’outils et de modèles pertinents pour ces études telle l’animalerie de rongeurs à flore contrôlé ou la collection de bactéries de Micalis 2/ une expertise et un savoir faire pour étudier les réponses de l’hôte (Cherbuy et al, 2004, Lardy et al, 2006, Zhang et al, 2006, Joly et al, 2009, Cherbuy et al, 2009 ; en révision) 3/ des compétences reconnues pour analyser la composition du microbiote commensal (Sokol et al, 2008 ; Joly et al, 2009 ; en révision).
Type de partenaire recherché :
Une collaboration avec un industriel ou un groupement professionnel du secteur agroalimentaire est envisagée dans le cadre d’une convention CIFRE (Convention industrielle de formation par la recherche).
A noter : Comme toute dépense concourant au développement de la R&D d'une entreprise, les charges engendrées par une CIFRE sont éligibles au Crédit d’impôt Recherche.
Intérêt industriel ou économique :
Décrire de nouvelles propriétés fonctionnelles des bifidobactéries et des lactobacilles, utilisés comme probiotiques.
Ce projet propose d’étudier l’effet des bifidobactéries et des lactobacilles sur l’intégrité de l’épithélium intestinal. Ces bactéries sont en effet des bactéries pionnières dans la colonisation du tube digestif à la naissance et sont largement utilisés par l’industrie agroalimentaire comme probiotiques.
Responsables scientifiques et coordonnées :
Philippe Langella
Directeur de Recherche; Responsable de l’équipe "Interactions des bactéries commensales et probiotiques avec l’hôte"
Unité Micalis ; INRA ; centre de Jouy-en-Josas
philippe.langella@jouy.inra.fr
Tél. : 01 34 65 20 70
Muriel Thomas
Chargée de Recherche; habilitation à diriger des recherches obtenue en 2007.
Unité Micalis ; INRA ; centre de Jouy-en-Josas
muriel.thomas@jouy.inra.fr
Tél. : 01 34 65 28 35
Claire Cherbuy
Ingénieur de Recherche
Unité Micalis ; INRA ; centre de Jouy-en-Josas
claire.cherbuy@jouy.inra.fr
Tél. : 01 34 65 24 98
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