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Programme GENOMIQUE ANIMALE


Le programme GENANIMAL a été lancé par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR) en 2005. Depuis, un appel à projets dont la gestion et l’animation ont été déléguées à l’INRA, est ouvert chaque année.

Ce programme de recherche s’est construit dans le prolongement des travaux menés dans le cadre du groupement d'intérêt scientifique AGENAE (Analyse du GENome des Animaux d'Elevage), et financés de 2002 à 2004 par le Ministère délégué à la Recherche.

En 2008, 2009 et 2010 l'appel à projets "GENOMIQUE" regroupe les précédents appels à projets GENANIMAL, GENOPLANTE 2010, et Génomique Microbienne à Grande Echelle (GMGE).

 

Toute l’actualité !

L'appel à projets de Génomique s'est clôturé le 6 avril 2010. Parmi les 25 projets soumis à l'axe de génomique animale et bioinformatique, 4 sont retenus en liste principale pour un financement et 3 en liste complémentaire.
 
> Télécharger la liste des projets retenus pour un financement

> voir la page de l'appel à projet 2010

Séminaire de restitution des projets AGENAE/GENANIMAL financés entre 2006 et 2008

Le séminaire GENANIMAL 2010 se déroule à Bordeaux du 8 au 10 novembre 2010.
Le huitième Séminaire général de restitution du programme GENANIMAL a pour objectif de faire le point sur les récentes avancées de la recherche dans le champ thématique de la Génomique Animale. Les projets présentés sont financés par l'Agence Nationale de la Recherche.
La journée du lundi 8 novembre est consacrée à la clôture de l'édition 2006 du programme ANR/Genanimal (9 présentations et 6 posters).
La journée du mardi 9 novembre permettra de faire le point sur l'avancement de plusieurs projets des éditions 2007 (3 présentations) et 2008 (6 présentations) et  2009 (1 présentation).
La matinée du mercredi 10 novembre est réservée au suivi à mi parcours des projets financés dans le cadre de l'édition 2008 du programme et ne concernait que les membres des instances du programme Genanimal: Comité d'Evaluation et Comité de Pilotage.

 > en savoir plus sur le séminaire...

Description du programme de génomique

Le programme de Génomique s’articule autour de 5 grands axes thématiques :
• Axe 1 : Génomique Animale
• Axe 2 : Génomique des plantes
• Axe 3 : Génomique microbienne à grande échelle
• Axe 4 : Bioinformatique pour la génomique
• Axe 5 : Méthodes innovantes de Phénotypage

L’axe 1 Génomique animale vise à renforcer et structurer une capacité nationale de recherche et d’expertise selon 3  sous thématiques :

(1) le développement d’outils, de méthodes et de ressources pour accéder aux connaissances et pour les valoriser ;
(2) l’acquisition de connaissances sur la structure, la diversité, l’expression des génomes et la régulation de celle-ci ;
(3) la valorisation des outils et des concepts de la génomique pour maintenir et améliorer la compétitivité de l’élevage, veiller à la santé et au bien-être des animaux, répondre aux attentes des consommateurs et participer à la protection de l’environnement.

En 2008, la thématique de recherche, auparavant définie dans le cadre du programme GENANIMAL, est ouverte et élargie dans plusieurs directions. Elle vise notamment à s’ouvrir à toutes les espèces animales représentant un enjeu de société au plan économique, social et environnemental, ainsi qu’à des espèces (telles que les espèces « modèles » par exemple) non concernées par ces enjeux en tant que telles, mais dont l’étude est importante pour la compréhension des phénomènes biologiques ayant un impact économique, social ou environnemental.

Cet axe thématique, permet de financer des projets de recherche fondamentale et des projets de recherche industrielle. Les projets de recherche industrielle devront impérativement bénéficier d’un cofinancement de la part d’un industriel, d’une filière professionnelle de l’élevage ou de toute structure susceptible de mobiliser des fonds pour faciliter la réalisation du programme. Ce cofinancement n’est pas un pré-requis pour les projets de recherche fondamentale.

Les projets attendus concernent la génomique, définie comme s’intéressant au génome dans son ensemble ou à une fraction très grande du génome. Elle utilise donc essentiellement des outils à grande échelle.

L’axe 2 Génomique des plantes porte sur la recherche en génomique fonctionnelle pour les caractères d’intérêt agronomique avec les objectifs de rendement et de développement de la plante en conditions de contraintes et la tolérance aux stress biotiques, les ressources méthodes et outils en génomique structurale et fonctionnelle et la participation de partenaires français à des consortium publics internationaux de séquençage de génomes complets.

L’axe 3 Génomique microbienne à grande échelle concerne la génomique à moyen et haut débit pour : les microorganismes pathogènes  ou symbiotes pour l’homme, l’élevage des animaux de rente  et les plantes ; les microorganismes photosynthétiques des milieux marins ; la métagénomique du tube digestif humain ; la métagénomique microbienne du sol, des stations d’épuration des eaux usées et des dispositifs impliquant des bioconversions ; la génomique à grande échelle pour l’identification de nouveaux gènes codant pour des enzymes capables de catalyser des réactions utiles en chimie industrielle.

L'axe  4 bioinformatique pour la génomique devrait permettre de satisfaire les besoins en logiciels d'analyses de séquences, d'annotation des gènes, d'alignement de séquences, de présentations graphiques et de gestion de bases de données.

L'axe 5 méthodes innovantes de phénotypage devrait permettre d'étendre la gamme des phénotypes analysés à des caractères plus fins et/ou à haut débit. 


Pour chacun de ces axes, les projets peuvent réunir uniquement des organismes publics et/ou des partenaires publics et privés.

Les recherches spécifiques aux OGM sont éligibles dès lors que des outils et ressources de la génomique sont significativement utilisés.

 

 

Contact : Cellule support du Programme GENANIMAL

Responsable scientifique:
Bernard Coudurier
Coordinateur :
Adrien GUICHAOUA - 01 42 75 90 23
Assistante:
Tyffanie Main - 01 42 75 94 18
Gestionnaire :
Philippe ROBIN - 01 42 75 95 85

Un seul contact mail :
genanimal@paris.inra.fr

 

21-23 octobre 2009
Tours

VIIe Séminaire Agenae / Genanimal

L’Inra, établissement-support en charge de l’animation et de la gestion du programme Génanimal de l’ANR, a organisé, avec le GIS Agenae, un séminaire général de restitution de ce programme. L’objectif Lire la suite

 

8-10 Novembre 2010
Bordeaux

VIIIe Colloque Agenae Genanimal

L’Inra, établissement-support en charge de l’animation et de la gestion du programme Génanimal de l’ANR, organise avec le GIS Agenae, un séminaire général de restitution de ce programme. L’objectif e Lire la suite
Site : https://colloque.inra.fr/agenae_genanimal

 

 
 

Rédaction :  Cellule de gestion du programme GENANIMAL
Date de création : 26 Janvier 2006
Date de dernière mise à jour : 26 Octobre 2010

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