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DE^CODAGE - Communauté d'annotation des génomes
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DE^CODAGE est une communauté francophone ayant un intérêt dans l'annotation des génomes, coordonnée par deux scientifiques du centre Inra de Clermont-Ferrand, France, et de l'Institut européen de bioinformatique (EMBL - EBI), Cambridge, Angleterre. Son ambition est d'inciter les échanges d'idées et les discussions.
Avec l'augmentation constante du nombre des génomes séquencés, mais surtout l'augmentation de la vitesse à laquelle les données sont produites, et les changements de la qualité de ces données, nous entrons dans une phase où l'annotation génomique n'est plus un processus entrepris par un petit groupe d'initiés. De plus en plus de laboratoires ont maintenant la(les) séquence(s) de leur(s) organisme(s) d'intérêt. Mais comment annoter ces séquences, fonctionnellement et structurellement ? Quelles différences entre un génome séquencé avec une technique traditionnelle, et un génome séquencé avec du « RNAseq » ? Différents types de données, différentes méthodes d'annotation ? Et plus largement : comment stocker ces annotations pour qu'elles soient facilement accessibles ? Comment les échanger ?
Annotation des génomes (gènes, éléments transposables...), adhérents, contacts, liens, liste de diffusion, réunions.
http://www6.inra.fr/decodage/
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Date de création : 19 Octobre 2011
Date de dernière mise à jour : 21 Octobre 2011
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