Un consortium international vient de rendre publique la première séquence
complète du génome d'un arbre : le peuplier (Populus).
Cette essence déjà connue pour sa grande valeur économique
et son intérêt environnemental accède ainsi au statut
d'arbre-modèle pour des dizaines de laboratoires.
200 scientifiques du monde entier
ont participé à ce séquençage, coordonné
par le "US Department of Energy", la fondation "Genome
Canada" et le "Umeå Plant Science Center"
Suédois. Quatre unités de recherche de l'INRA y ont contribué
: Nancy, Orléans, Bordeaux et une unité de recherche INRA associée
à l'université de Gand en Belgique.
Le peuplier a été
choisi en raison de son génome relativement compact : presque 50 fois
plus petit que le génome du pin, ce qui en fait l'arbre-modèle
idéal. Il comporte 19 paires de chromosomes soit quatre fois plus que
le génome de la première plante séquencée il y
a 4 ans : l'arabette.
Cet inventaire des 40 000 gènes
du peuplier permettra, grâce à des travaux complémentaires
en physiologie, en biologie et en écologie une avancée spectaculaire
des connaissances sur les arbres. Les équipes de l'INRA ayant collaboré
à ce programme se réjouissent du décryptage de ce génome
qui accélérera les programmes de recherche déjà
en cours à l'INRA sur : la formation du bois, la nutrition, la résistance
à la sécheresse et aux pathogènes, le fonctionnement
des symbioses mycorhiziennes etc.
Les connaissances ainsi acquises ont une portée plus générale
: elles aideront à améliorer les propriétés sylvicoles
et biotechnologiques d'autres espèces d'arbres et conduiront à
une gestion plus durable des milieux forestiers.
> Stefan Jansson du "Umeå
Plant Science Center", coordonnateur du projet, présentera
ces travaux en France le 21 septembre à l'INRA d'Orléans
et le 22 septembre à Lyon au colloque Plant GEMs.
> Contacts scientifiques
internationaux :
- The International Poplar Consortium
: http://www.ornl.gov/sci/ipgc/
Gerald Tuskan, gtk@ornl.gov
- Oak Ridge National Laboratory : http://www.ornl.gov
Ron Walli, 865-576-0226; wallira@ornl.gov
- DOE Joint Genome Institute (JGI) : http://www.jgi.doe.gov
David Gilbert, gilbert21@llnl.gov
- Genome Canada : http://www.genomecanada.ca/
Anie Perrault, aperrault@GENOMECANADA.CA
- Genome British Columbia : http://www.genomebc.ca/
Linda Bartz, lbartz@genomebc.ca
- Umeå Plant Science Centre : http://www.upsc.nu/
Stefan Jansson, stefan.jansson@plantphys.umu.se
- Stanford Human Genome Center : http://www-shgc.stanford.edu
Ruthann Richter, richter1@stanford.edu
- Department of Plant Systems Biology and INRA-associated laboratory at Gent
University : http://www.psb.ugent.be/
Yves Van de Peer, yves.vandepeer@psb.ugent.be
> Contacts scientifiques
INRA :
- Laboratoire associé
INRA-Université de Gand, Belgique, Pierre Rouzé Pierre.Rouze@psb.ugent.be
- INRA Nancy : Francis Martin, fmartin@nancy.inra.fr tél
: 03 83 39 40 80
- INRA Orléans : Gilles Pilate, pilate@orleans.inra.fr
ou Catherine Bastien catherine.bastien@orleans.inra.fr
ou Philippe Label label@orleans.inra.fr
tél : 02 38 41 78 29
- INRA Bordeaux Christophe Plomion, plomion@pierroton.inra.fr
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