La place de la virologie au sein du Département Santé Animale

Les équipes de virologie INRA sont parfaitement insérées dans les dispositifs nationaux. Les Journées Francophones de Virologie, soutenues par le Département SA, réunissent depuis 1999 chaque année entre 400 et 600 virologistes autour de thèmes choisis par un comité scientifique de 20 membres dont 4 appartiennent au Département SA. L’insertion internationale est aussi attestée par l’existence de nombreux réseaux de collaboration, la prise en charge de l’organisation de réunions internationales et une forte présence des équipes de virologie INRA dans les programmes européens de recherche.

La virologie se confond de plus en plus avec d’autres domaines de la biologie, comme la biologie cellulaire, la biologie structurale ou l’immunologie, et il devient difficile d’en tracer les frontières. Par ailleurs, le développement de la biologie à haut débit pose un défi nouveau aux virologistes, qui sont les plus à même d’aborder par des approches systémiques fonctionnelles, les champs de l’interactome ou bien des relations entre structures et fonctions dans le cycle viral. Les thématiques actuelles en virologie présentent un certain degré de foisonnement. Malgré cela, certaines familles virales ne sont pas couvertes par l’INRA et cela peut représenter une carence fortement dommageable en cas d’émergence dans une de ces familles. Cette carence apparente peut être palliée pour partie par des investissements significatifs dans la génomique appliquée à la virologie et dans les disciplines transversales (immunologie, biologie cellulaire, biologie à haut débit), s’ils sont associés à une politique de partenariat incitative.

Les orientations en virologie

Malgré de très bonnes performances scientifiques, la structuration actuelle conduit à un déficit de compréhension par les partenaires des filières. Toutefois, si la virologie est de par ses objets, un domaine fondamental pour la Santé Animale, il l’est aussi par les concepts apportés en matière de réponse immune ou de biologie cellulaire et en signalisation où les outils viraux constituent des outils performants pour l’exploration du fonctionnement intime de la cellule.
Sans négliger les missions traditionnelles des virologues (biologie et cycle viral, diagnostic, cibles vaccinales) le développement de recherches cognitives (et par voie de conséquence publiées dans des revues généralistes), est un enjeu du Schéma Stratégique du Département Santé Animale. L’ensemble des compétences en virologie que constituent les 3 unités du centre Inra de Jouy (UR892 VIM, UMR avec le CNRS 1157 VMS, UMR 1161 AFSSA DGER INRA Virologie) doit être conforté avec des recrutements en Chargés de Recherche : la morphogenèse virale (assemblage de structures virales pour des objectifs de diagnostic et de vaccination), la virologie des poissons, la virologie structurale en association avec le partenaire CNRS (designing de cibles de thérapeutique anti-virale), les viroses émergentes et zoonotiques (notamment avec le partenaire AFSSA et CIRAD).

Le premier objectif du schéma stratégique de département (SSD) est de développer une dynamique fondée sur le centre de Jouy-en-Josas, qui doit devenir une tête de réseau pour une coordination des virologues de Lyon (rétrovirologie), de Toulouse (dynamique des génomes viraux, pox virologie) et de Tours (virologie aviaire). Le second objectif de la période quadriennale actuelle est la consolidation et le fonctionnement du réseau qui a été créé en 2003 et qui doit s’établir sur la durée. Le partenariat avec les organismes en charge de la virologie en France (Institut Pasteur, CIRAD, AFSSA) et en Europe doit être l’occasion d’une coordination plus aboutie entre équipes. C’est la voie la plus sure permettant à cette communauté scientifique de répondre aux urgences sanitaires qui se traduisent par des pressions pour des mobilités thématiques à répétition.