Tâche 2 : Modèles épidémiologiques pour l’analyse et la simulation de maladies telluriques et de moyens de contrôle en successions culturales
Coordinateur : Douglas J. Bailey, INRA Rennes, UMR BiO3P
Les approches traditionnelles pour étudier l’efficacité de méthode de lutte contre les maladies reposent sur des expérimentations, généralement avec un nombre limité de répétitions et une seule observation au cours de la culture. Cette stratégie est pertinente quand il s’agit de tester des techniques individuelles de traitement mais l’
absence de prise en compte de données épidémiologiques rend difficile d’en déduire comment en améliorer l’efficacité ou en estimer le risque d’échec. De toute évidence, ce type d’approche n’offre pas un cadre permettant de convertir les actuels systèmes de cultures basés sur l’utilisation de pesticides en systèmes à utilisation réduite de ces intrants.

Cette tâche du projet SYSBIOTEL a pour objectif de
construire et tester une théorie cohérente pour le déploiement de méthodes de gestion de bioagresseurs telluriques sur une succession culturale. En se fondant sur des mécanismes épidémiologiques, la théorie proposée englobera l’explication des mécanismes d’invasion de maladie à l’échelle de la culture, et sa persistance à l’échelle de la succession culturale. Cette approche s’appuie sur les constations suivantes :
- Le niveau de maladie au cours d’une succession est le reflet de processus d’amplification, de déclin, et de dispersion de l’inoculum tout au long de phases saprophytiques et parasitaires successives
- Le niveau de contrôle au cours d’une saison influence la quantité et la distribution d’inoculum pour la culture suivante.
L’approche s’appuiera sur une théorie déjà testée sur le développement de maladies au sein d’une culture et utilisera la modélisation en épidémiologie pour lier les dynamiques de maladie à l’intérieur de cultures successives aux dynamiques d’inoculum à l’intérieur et entre ces cultures. L’approche, bien que focalisée sur maladies telluriques, sera suffisamment générique pour être adaptée à d’autres pathogènes ayant une phase de survie entre deux cultures successives. Cette partie du projet SYSBIOTEL s’appuie sur l’expertise de l’Epidemiology and Modelling Group de l’Université de Cambridge avec lequel l’équipe EPSOS de l’UMR 1099 entretient une collaboration étroite.
La formulation des modèles impliquera la participation de producteurs dès le départ, un questionnaire structure permettant d’aider à identifier les processus épidémiologiques clés et leur importance au cours de successions culturales. (Tâche1). Les expérimentations nécessaires à l’estimation des paramètres et à la validation seront une composante importante, qui sera conduite, au sein de SYSBIOTEL, dans la tâche 3.
Rédaction :
SYSBIOTEL
Date de création : 18 Juin 2009
Mise à jour : 21 Avril 2010
Contact :
Douglas BAILEY