La Tâche 5 du projet SYSBIOTEL à pour objectif de concevoir la gestion des bioagresseurs à partir d’un questionnement construit dans le cadre conceptual de l’écologie des communautés, avec une attention particulière pour la biodiversité et sa contribution aux services écologiques. Cette tâche se concentre sur l’écologie de communautés de bioagresseurs (considérées comme répondant à des ‘filtres’ environnementaux) et sur la gestion de la biodiversité de ces bioagresseurs (considérée comme une réponse de groupe au travers de fonctions de parasitisme). Il est donc important d’engager des etudes d’écologie sur les coexistences d’espèces et leurs interactions qui façonnent ces communautés et qui en retour affectent la production. De tels concepts sont innovants par l’anticipation qu’ils offrent pour gérer l’organisation des communautés de parasites et agents pathogens avant leur établissement final et les conséquences pathologiques sur les cultures.
Parce que les nématodes parasites ainsi que les champignons pathogènes sont généralement trouvés en communautés, ces deux groupes de bioagresseurs sont proposés comme modèles d’étude pour mieux comprendre les déterminants de ces structures et les conséquences pathologiques correspondantes pour les cultures.
Dans ce but, la Tâche 5 de SYSBIOTEL étudiera les structurations entre espèces (dans l’espace et dans le temps), en réponse à des conditions de ’stress’ induites sur les communautés initiales (avant mise en culture) de ces pathogènes et parasites, en communautés pathologiques sur les cultures mises en place et sur l’évolution de ces communautés au cours des successions culturales et la mise en place de différentes méthodes et stratégies de protection de ces cultures. Les bioagresseurs telluriques sont communément contrôlés par des pesticides (sur carotte seulement). Cependant des méthodes alternatives sont en cours de développement, basée sur la gestion de l’interculture (entre maïs et carotte) avec des cultures assainissantes.
Le travail sera principalement réalisé sur deux groupes, des nématodes phyto-parasites (appartenant aux ordres des Tylenchida et Dorylaimida) et des champignons phytopathogènes ( Rhizoctonia spp. et Fusarium spp.), sur leur champignon antagoniste commun (Trichoderma spp.) et sur les communautés microbiennes associées, et concernera la succession maïs – carotte mise en place derrière forêt de pin dans la région Aquitaine. La Tâche 5 de SYSBIOTEL concernera donc le système agro-forestier de la région Aquitaine (Sud-Ouest de la France), plus particulièrement dans la région des Landes. Les forêts de pin (Pinus pinaster) ont été plantées il y a 200 ans et les arbres sont exploités tous les 40 ans. Depuis les années 50, la déforestation a été entreprise dans quelques zones qui ont ensuite été exploitées en monoculture de maïs et, depuis une quinzaine d’années pour certains endroits, en successions maïs – carotte (généralement une culture de carotte tous les 3 ou 4 ans).
Les principaux partenaires engagés sur cette tâche sont l’UMR CBGP, Montpellier et l’UMR MSE, Dijon avec la contribution d’ALTUS et du GRCETA SFA, deux organisations mises en place par les agriculteurs. (Crédits photo IRD)